Источник электронов и источник углерода
Донорами электронов у разных хемолитотрофов служат водород, восстановленные соединения серы, аммиак, нитрит или двухвалентное железо. Термин описывает энергетический обмен и источник электронов. Если углерод для построения клеточного вещества поступает из CO₂, организм дополнительно характеризуют как автотрофный. Эти признаки классификации рассматриваются раздельно. [3]
Окисление соединений азота
Нитрифицирующие микроорганизмы получают энергию при окислении восстановленных неорганических соединений азота. Традиционно нитрификацию описывали как две стадии: образование нитрита из аммиака и образование нитрата из нитрита, выполняемые разными группами. Такие организмы участвуют в превращениях азота в природных водах, почвах и инженерных системах. [2]
Полная нитрификация Nitrospira
В 2015 году у представителей Nitrospira была описана способность выполнять весь процесс окисления аммиака до нитрата в одной клетке. Для этого типа обмена используют название comammox — сокращение от complete ammonia oxidation. Открытие дополнило представление о разделении двух стадий нитрификации между отдельными организмами. [2]
Использование атмосферного водорода
В работе 2022 года исследовали потребление водорода нитритокисляющей бактерией Nitrospira moscoviensis. Показано окисление водорода, в том числе при очень низких концентрациях, сопоставимых с атмосферными. Этот пример отражает метаболическую гибкость конкретного организма: характеристика по одному привычному субстрату не обязательно перечисляет все доступные ему источники электронов. [1]