Исследователи составили пространственный атлас активности генов европейской ели (Picea abies), показывающий изменения в тканях при формировании репродуктивных органов. Работа опубликована в журнале Cell.
Для исследования использовали пространственную транскриптомику — метод, позволяющий определять активность генов с сохранением информации о расположении клеток в ткани. Такой подход помогает установить, в каких участках развивающегося побега работают гены, связанные с образованием шишек, и как эта картина меняется со временем.
Учёные изучали тонкие срезы тканей толщиной 10 микрометров — одну сотую миллиметра. Полученные данные объединили в атлас, позволяющий сопоставлять пространственное распределение активности генов на разных стадиях развития.
Одним из результатов стало выявление ранее не описанного гена DAL55, связанного с сигнальными процессами репродуктивного развития. Он также упоминается в предварительной версии исследования, размещённой в репозитории KTH. Таким образом, публикации в Cell предшествовала работа авторов над изучением этих механизмов.
Практический интерес исследования связан с длительным циклом размножения ели, который замедляет селекцию. Понимание того, как регулируется формирование шишек, может помочь в разработке способов ускорить получение следующих поколений деревьев.
Использование атласа для выведения ели, устойчивой к климатическим изменениям, остаётся перспективой.
